O CNBC é constituído de duas estruturas complementares, a Administrativa e a Deliberativa.
Estrutura Deliberativa:
São as instâncias que deliberam sobre as questões, decisões e rumos institucionais;
Assembleia Geral.
Plenárias.
Presidência.
Estrutura Administrativa:
A Estrutura administrativa é composta pela Presidência, Diretoria, Secretarias e Comissões.
Responsável pela existência institucional e pela manutenção dos serviços oferecidos pelo CNBC
Presidência: Presidente e Vice-presidente
Diretoria: Diretor administrativo, Diretor Financeiro, Conselho Fiscal
Secretaria-Geral Institucional
Secretaria de Ajuda Humanitária
Secretaria de Assuntos Jurídicos
Secretaria de Assuntos Legislativos
Secretaria de Atendimento
Secretaria de Certificação
Secretaria de Comunicação
Secretaria de Desenvolvimento
Secretaria de Direitos Humanos e inclusão social
Secretaria de Educação
Secretaria de Eventos e promoção.
Secretaria de Finanças
Secretaria de Intermediação e Gestão de Crises
Secretaria de Meio Ambiente e Sustentabilidade
Secretaria de Normalização e conformidade.
Secretaria de Pesquisa e Inovação
Secretaria de Proteção e Defesa
Secretaria de Recursos Humanos
Secretaria de Registros
Secretaria de Relações Institucionais
Secretaria de Relações Internacionais
Secretaria de Tecnologia e Informação
Secretaria de Trabalho e Emprego
Secretarias Regionais
Comissões especiais.