O CNBC é constituído de duas estruturas complementares, a Administrativa e a Deliberativa.

Estrutura Deliberativa:

São as instâncias que deliberam sobre as questões, decisões e rumos institucionais;

Assembleia Geral.

Plenárias.

Presidência.

Estrutura Administrativa:

A Estrutura administrativa é composta pela Presidência, Diretoria, Secretarias e Comissões.
Responsável pela existência institucional e pela manutenção dos serviços oferecidos pelo CNBC

Presidência: Presidente e Vice-presidente

Diretoria: Diretor administrativo, Diretor Financeiro, Conselho Fiscal

Secretaria-Geral Institucional

Secretaria de Ajuda Humanitária
Secretaria de Assuntos Jurídicos
Secretaria de Assuntos Legislativos
Secretaria de Atendimento
Secretaria de Certificação
Secretaria de Comunicação
Secretaria de Desenvolvimento
Secretaria de Direitos Humanos e inclusão social
Secretaria de Educação
Secretaria de Eventos e promoção.
Secretaria de Finanças
Secretaria de Intermediação e Gestão de Crises

Secretaria de Meio Ambiente e Sustentabilidade
Secretaria de Normalização e conformidade.
Secretaria de Pesquisa e Inovação
Secretaria de Proteção e Defesa
Secretaria de Recursos Humanos
Secretaria de Registros
Secretaria de Relações Institucionais
Secretaria de Relações Internacionais
Secretaria de Tecnologia e Informação
Secretaria de Trabalho e Emprego

Secretarias Regionais

Comissões especiais.